Tarkastelukaudella 2007–2009 Orionin merkittävimmät ympäristöinvestoinnit ajoittuivat vuoteen 2007, jolloin valmistuivat investoinnit yhtiön toimipaikkoja koskeneiden tiukentuneiden ympäristölupien vaatimusten täyttämiseksi. Investoinneista merkittävimmät kohdistuivat liuotin- ja VOC-ilmapäästöjen vähentämiseen. Fermionin Hangon tehtaan yhteyteen rakennettiin terminen VOC-kaasujen käsittelylaitos ja jätevesien tasausallas. Oulun tehtaalle rakennettiin katalyyttinen VOC-polttolaitos.

Merkittäviä investointeja on tehty myös kaasunpesureihin Espoon ja Turun lääkevalmistetuotannossa. Kaikilla laitoksilla on parannettu ja parannetaan edelleen jätevesien käsittelyä ja energiataloutta.